品質評価試験
iPS細胞・iPS細胞由来分化細胞やiPS細胞を用いた研究・医療応用等に関する検体の品質評価試験を受託しております。生存率、未分化マーカーの発現試験、プラスミドの残存試験、全ゲノム解析などの試験項目からお選びいただけます。試験系の構築も承りますので、お気軽にご相談下さい。
なお、当財団は、iPS細胞の臨床応⽤のための⽀援や推進を⾏うことを⽬的として事業を⾏っておりますので、原則、この⽬的に沿ったご依頼を受託しております。
試験項⽬⼀覧
ゲノム解析
全ゲノム解析
KAPA社の KAPA Hyper Prep Kit PCR-freeを用いて全ゲノムシーケンス用ライブラリーを調製した後、Illumina社の次世代シーケンサーを用いてシーケンスを行います。
ゲノム解析
エクソームシーケンス
Twist社のライブラリー調製キットを用いてエクソームシーケンス用ライブラリーを調製した後、Illumina社の次世代シーケンサーを用いてシーケンスを行います。
ゲノム解析
SNPアレイ解析
Illumina社のInfiniumビーズチップを用いたSNP解析を行います。
シーケンス
ライブラリーシーケンス
Illumina社の次世代シーケンサー用に調製されたライブラリーをお預かりしてシーケンスを行います。
残存試験
プラスミド残存試験
iPS細胞より抽出したゲノムDNAを鋳型として、各プラスミド上の外来遺伝子を増幅する定量PCRを行い、iPS細胞に残存するプラスミドの有無を調べます。
フローサイトメトリー
フローサイトメトリーを⽤いた未分化マーカーの発現解析
iPS細胞の多能性を示す指標として、TRA-1-60、SSEA-4、TRA-2-49、Oct3/4といった未分化マーカーを用いたタンパク質の発現を、フローサイトメトリー（BD FACS Canto II /BD FACS Lyric）を用いて解析します。
遺伝⼦発現解析
バルクRNAシーケンス解析
Illumina社のTruSeq Stranded Total RNAを用いてRNAシーケンス用ライブラリーを調製した後、Illumina社の次世代シーケンサーを用いてシーケンスを行います。
シングルセル解析
シングルセルシーケンス解析
10x Genomics社のChromium Xを用いてシーケンス用ライブラリーを調製した後、Illumina社の次世代シーケンサーNovaSeq 6000を用いてシーケンスを行います。
メチル化解析
メチル化アレイ解析
Illumina社のInfinium MethylationEPICビーズチップを用いたDNAメチル化解析を行います。