エクソームシーケンス解析

Twist社のライブラリー調製キットを用いてエクソームシーケンス用ライブラリを調製した後、Illumina社の次世代シーケンサーを用いてシーケンスを行います。
目標出力データ量をご相談いただけます。
本サービスは、iPS細胞の臨床応用支援を目的としており、iPS細胞を用いて再生医療の研究開発を推進している研究機関・企業を対象に提供しています。

特色

  • Twist社のTwist Library Preparation Kitでプレライブラリを調製した後、Twist Comprehensive Exomeを用いてエクソン領域を濃縮。ゲノムのエクソン領域のみを濃縮してシーケンスするため、コストを大幅に低減できます。
  • 他のパネルをご希望の場合は
    ご相談ください
  • Illumina社のNovaSeq 6000を用いて101PEでシーケンスを実施
  • オプションでペアサンプルを用いた比較解析(SNV解析)が可能です
  • その他FASTQファイルからの解析もご相談いただけます

  • 当財団は、Twist Bioscience社が認定する、
    認証サービスプロバイダー(Twist NGS PROLAB)です。

サンプル条件

サンプル ヒト精製ゲノムDNA
DNA量 100 ng 以上
濃度 10ng/µL 以上
溶媒 DDW
純度 OD260/280:1.8程度以上
  • サンプルの定量はQubitで行って頂くことを推奨しております。もし他の機器で測定される場合、測定機器名をお知らせ下さい。

シーケンス機器の仕様

ご要望の出⼒データ量に応じて使⽤するフローセルなどご提案いたします。

NovaSeq6000

フローセルタイプ 出⼒リード数(ペアエンド) 2 x 100 bp
SP (2 lane) 1,300-1,600 M 134-167 Gb
S1 (2 lane) 2,600-3,200 M 266-333 Gb
S2 (2 lane) 6,600-8,200 M 667-833 Gb
S4 (4 lane) 16,000-20,000 M 1,600-2,000 Gb
  • 出力データ量は目安であり、保証するものではありません。

解析例

16検体のエクソームシーケンス解析

ライブラリー作製キット Twist Library Preparation Kit+Twist Comprehensive Exome
使用機種 NovaSeq 6000
シーケンス方法 SPフローセル占有、101bpでのペアエンドシーケンス
平均データ量 10Gb/サンプル(CDSのシーケンス深度130x)

納品物

  • シーケンスデータ(FASTQファイル等)
  • オプションでご依頼いただいた解析データ
  • 作業の概要

エクソームシーケンス解析お申込みの流れ

  1. お客様 お申込み

    下記フォームからお申込みください。

    お申込みフォーム

  2. CiRA_F お申込み内容確認

    お申込みいただいた内容の確認を⾏い連絡いたします。

  3. お客様 サンプルのご提出

    サンプルのご提出をお願いいたします。

  4. CiRA_F 品質評価試験

    以下の試験を⾏います。

    • ゲノムDNAの品質確認
    • ライブラリー作製
    • 次世代シーケンサーを⽤いたシーケンシング
    • 変異検出(オプション)
  5. CiRA_F 解析結果のご返却
    費⽤のご請求

    解析結果をご返却いたします。請求書をお送りいたしますので、期⽇までにお⽀払いをお願いいたします。

関連サービス

  • DNA抽出